El programa de Maestría en Ciencias de la Computación está apoyado principalmente por dos Cuerpos Académicos de la Facultad de Matemáticas: "Tecnologías Emergentes en Computación" y "Modelación y Simulación Computacional de Sistemas Inteligentes". Aunque cada profesor que participa en el Núcleo Académico Básico del programa tiene objetivos y líneas de investigación particulares, todos ellos realizan investigación en Ciencias de la Computación.

Línea “Sistemas Inteligentes”

Objetivo:  Desarrollar soluciones computacionales innovadoras en las áreas de aprendizaje automático, procesamiento de imágenes y visión computacional. 

Disciplinas del conocimiento: Aprendizaje Automático, Visión Computacional, Robótica, Cómputo Científico, Sistemas Embebidos.

Línea “Ciencia y Tecnología de la Información”

Objetivo:  Investigar, diseñar e implementar sistemas computacionales para recolectar, almacenar, administrar, procesar, comunicar y aplicar información proveniente de diversas fuentes, en la solución de problemas de diversa índole. 

 Disciplinas del conocimiento: Algoritmos computacionales, Gestión del conocimiento y del aprendizaje, Redes de computadoras, Visualización y gráficas por computadora, Ingeniería de sistemas de información, Ingeniería Biomédica, Computación de alto rendimiento, Tecnología Educativa.

Línea de Investigación	Integrante	Nivel SNI	Perfil Prodep	ORCID
Ciencia y Tecnología de la Información	Dr. Francisco Alejandro Madera Ramírez	I	X
	Dr. Francisco Moo Mena	I	X
	Dr. Jorge Ricardo Gómez Montalvo	I	X
	Dr. Jorge Alberto Ríos Martínez	I	X
	Dr. Víctor Hugo Menéndez Domínguez	I	X
	Dr. Raúl Antonio Aguilar Vera	I	X
Sistemas Inteligentes	Dr. Arturo Espinosa Romero	I	X
	Dr. Carlos Brito Loeza	I	X
	Dr. Víctor Uc Cetina	I	X
	Dr. Ricardo Legarda Sáenz	II	X
	Dra. Anabel Martín González	I	X